FC2ホームぺージではテンプレートでjQueryが使えるように設定されています。またjQueryを使って構成される多くのページでは、サイト共通で使用するJavasSriptも使用していると思われるます。このようなサイト（ひな型をコピーして作成するWebサーバサービスが多いと思います）で、文章や画像、広告を後から指定の位置に書き込むことができないか確認してみました。

　jQueryのappendやafterなどを使うと、文章や画像の追加はある程度できるようです。ただ、一般的な広告サイトでJavaScriptを埋め込むようなものは、onloadイベントで実行されるJavaScriotで、指定の位置に広告を共通的に挟み込むようなことはできないようです。
　詳細は下記にまとめているので、興味のある人は参照してみてください。